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由于分子蒸餾技術的科技含量高，應用范圍廣，因此分子蒸餾技術成為一項工業化應用前景十分廣闊的高新技術。包括在聚酞胺樹脂工業中，分子蒸餾技術可以用來脫除熱敏性物質中的輕組物，而在甲基丙烯酸酯類合成過程中，分子蒸餾技術又可降低熱敏性物質的熱損傷。此外，利用分子蒸餾技術制取高純烷基多苷，可以消除或降低生產過程中的環境污染，進行清潔生產等。
隨著分子蒸餾技術的不斷完善，其應用不止局限于化工工業領域。在芳香油生產工業中，分子蒸餾技術主要用于揮發油類和油脂類等低級性物質的分離純化，用來脫除原料或產品中的雜質及顏色。
分子蒸餾技術助力食品工業發展
在食品工業中，分子蒸餾技術常常被用于提取和制備，包括提取天然色素、制備高純度食品添加劑、分離純化不飽和脂肪酸等。隨著分子蒸餾技術應用領域的不斷擴大，也為食品工業發展提供了有效便捷的方式。
同時，分子蒸餾在獲取風味物質及油脂脫酸、脫色上也有一番作為。分子蒸餾技術在油脂加工中可用于降低毛油的高酸值，此外，在較低的溫度下進行玫瑰精油的分子蒸餾，由于濃縮物還原性好，可大幅度提高了玫瑰精油的品質得率。
