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水中菌藻類微生物的主體是細胞,這種微生物的基本結構是外層為細胞膜、中層是細胞質,核心是細胞核(DNA)。傳統殺菌滅藻的方法如:臭氧,原理上均是采用氧化方式,利用化學物質的強氧化作用,直接破壞細胞膜,達到殺菌的目的。滅菌器是利用高能電磁場中的高頻電磁波、電場微電流、活性水分子中的電子都對菌藻類微生物有較強殺滅力,破裂其細胞壁,并直接破壞其賴以生存的酶系統,從而阻止菌、藻類微生物吸收葡萄糖,停止其新陳代謝,使其死亡,達到殺滅去除目的。