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減速電機的冷卻狀況決定了機器的溫度，而溫升又直接影響到減速電機的使用壽命和額定容量。因此，冷卻問題是減速電機設計制造和運行維護中的重要問題，其核心是選擇經濟有效的冷卻介質和冷卻方式。
1.冷卻介質
(1)氣體。減速電機中采用的氣體冷卻介質有空氣和氫氣等。氫氣的密度小(約為空氣的1/10),可降低通風摩擦損耗，明顯提高減速電機效率，且熱容量大，能顯著改善冷卻效果，故在需要強化冷卻手段的大型汽輪發減速電機(單機容量在BMW以上)中得以廣泛應用。一般來說，從空氣冷卻改為氫氣冷卻后，汽輪發減速電機轉子繞組的溫升約降低一半，減速電機容量約提高1/4左右，效果是非常顯著的。不過，采用氫氣冷卻的成本很高，并且還要求防漏、防爆等保證措施，因此大部分減速電機仍首選空氣冷卻。
(2)液體。主要采用水、油等冷卻介質。由于液體的熱容量和導熱能力遠大于氣體，因此冷卻效果也就優越得多。電力變壓器大都采用油浸冷卻方式。汽輪發減速電機改空氣冷卻為水冷，容量可成倍提高。不過，液體冷卻中也面臨泄漏和積垢堵塞等新問題。
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