咨詢超凈臺的客戶在挑選凈化工作臺的時候問的多的一句話也許就是“水平超凈臺和垂直超凈臺有什么區別”呢？其實這句話折射了消費者對水平凈化臺和垂直凈化臺的不理解，認為這兩者可能存在著很大的差別，甚至有的客戶會詢問水平凈化工作臺和垂直凈化工作臺哪個效果好的問題。
其實水平超凈臺和垂直超凈臺的工作原理是完全相同的，所不同的只是外觀形式；從字面意思來理解，水平超凈臺的風是水平的，平面的。而垂直超凈臺的風向是垂直層流，風是從上往下吹的。打個簡單的比方，水平層流的超凈臺如同放在桌面的臺扇，垂直層流的凈化工作臺如同吊在天花板上的吊扇。雖然比方不是很恰當，但是可以讓消費有個感性的認識。
從潔凈度上來理解：水平超凈臺和垂直超凈臺的效率是完全相同的，不存在潔凈度的高低之差別。都是達到美聯邦標準的209E百級凈化。如果達不到百級凈化的超凈臺那就是一個次品。
從價格上來區分：從材料和做工的復雜程度來說，垂直超凈工作臺要復雜一些，要費料費工一些，價格人略比水平的貴，但相關不大，差價應該在500元之內；
從封閉程度上來講：水平工作臺是敞開式的，垂直超凈工作臺前面有升降玻璃擋板或有機玻璃檔板，垂直超凈臺不用的時候可以交擋板放下封閉越來；
從使用場所上區別：水平流目前主要是食品檢驗，花卉、樹苗、食用菌接種組培；垂直層流應用于電子、化工、醫院、醫藥行業。也是因為一些化工、制藥企業的實驗操作過程中會有一些有毒有害氣體會影響人體健康，所以選擇往下吹風的垂直層流而不是水一層流似乎更合適一些。