在除鐵錳濾池中運行時，水中低價鐵錳離子先被覆合錳砂濾膜吸附，然后被氧化和水解，生成氫氧化物水合分子[Fe(OH)3XH2O] 和[Mn(OH)nXH2O] 形成的活性濾膜，并作為新的催化劑參與接觸氧化反應，使活性濾膜有隨著使用增厚的趨勢，形成了覆合錳砂的自修復特性,使用一年的覆合錳砂，錳含量增加18.2%，鐵含量增加4.8%；使用兩年半的錳含量增加了27.3%，鐵含量增加14.3%.錳砂容重較低(為1.55～1.60g/cm3)，特別適用于大中型水廠的虹吸除鐵錳濾池和各型除鐵錳濾罐 虹吸濾池由于反沖洗水頭較低，往往不宜于使用容重較大的天然錳砂濾料（其容重一般為2.2～2.4g/cm3），使大中型水廠除鐵錳濾池的設計使用受到一定限制。
在水質軟化過程中，首先，由于錳砂軟化水的處理時間有限，其次，由于水中有鐵單質，三氧化二鐵，氧化亞鐵等鐵的氧化物，各種物質混合，使錳砂的除鐵除錳效果，軟化水效果大幅度降低，所以為了增加錳砂除鐵除錳的效果，就要在錳砂處理工藝前加一道曝氣處理工藝，是除鐵除錳達到最佳的效果！可根據水質的不同組合形式選用不同比列的厭氧—好氧—兼氧的生物處理工藝，這種工藝不但有優異的脫氮除磷效果，而且能夠把大分子量的有機物裂解成易于好氧生物降解的低分子量有機物。最重要的是能夠將鐵單質，單質錳，氧化亞鐵，低價氧化錳，氧化成高價鐵的氧化物！這樣錳砂的除鐵除錳壓力就降低了，整體處理效果最佳！
天然錳砂池他的反沖洗時間一般為5-15分鐘。天然錳砂 池料表面的“活性濾膜“結構比較硫松，能在長時間的沖洗中破壞， 所以濾池的反沖洗應以不破壞濾料表面的“活性論膜”為度。 否期會引起濾后水質嚴重惡化，在地下水除鐵濾池中，應采用不易為鐵質堵塞的配水系統形式。推薦采用上設承托層的管式大阻力配水系統和格 栩式或孔板式小阻力配水系統。