其次，自然人的軟件著作權的確認還需要具體的軟件運行監測。無論是什么樣的軟件，都要有具有的東西，要讓人們看到軟件的使用效果，也就是要把這個模型落實到代碼上。這是軟件著作權認定的核心程序，只有讓人們看到軟件真正使用的效果才能對軟件的著作權進行確認。軟件的設計具有很強的重復性，不過軟件呈現出來的東西則千差萬別，所以在認證的時候需要呈現出具體的軟件內容。 在申請登記上要注意這軟件應該是獨立開發的，或是經過了原著版權人的許可可對這原有軟件修改后有新的軟件來登記。要是合作開發的軟件著作權登記，這是要由全體著作權人協商確定一名代理人辦理登記。提交填寫的軟件著作權登記申請表，還有交軟件的鑒別材料、相關的證明文件，提交到機構后，這就是要審查的，不過這審查很快，之后會簽字完成登記。 這種軟件著作權它一經登記之后，就可以去保護軟件開發的人、他們的發表權、使用權之類的。這種權利它本質上面就是從保護我們的利益出發的，只要我們開發了這個軟件，它就可以去保護我們的。 而專利與軟件著作權則不同，專利是起到了直接的保護作用。專利的申請要先向專利局提出申請，需要詳細的描述自己的軟件構思以及技術方案等等，需要用言語描寫出來。一般專利的保護方面更多，也更涉及到核心部分，比起軟件著作權來說有了更好的保護意義，這也是現在為什么越來越多的人會選擇采用專利申請保護的方式，能夠更好地維護自我效益，安全有保障。