電磁流量計在使用的過程當中，可能出現各種各樣的故障，但總的說來可以把所有的故障歸結為兩類，即調試期故障和運行期故障。
所謂的調試期故障一般出現在儀表安裝調試階段，這種故障一經排除，在以后相同的條件下不會再出現的。主要表現在安裝方面、環境方面和流體方面。
安裝方面：通常是指由電磁流量計安裝不正確引起的故障，常見的有如傳感器安裝在自上而下的垂直管上，或易積聚氣體的管系zui高點；或傳感器后無背壓，流體直接排入大氣而形成測量管內非滿管。這幾種情況都有可能導致電磁流量計使用出現故障。
環境方面：通常主要是空間強電磁波干擾，管道雜散電流干擾，大型電機磁場干擾等。空間電磁波干擾一般經信號電 纜引入，通常采用單層或多層屏蔽予以保護。而管道雜散電流干擾則通常采取良好的單獨接地保護就可獲得滿意結果，但如果遇到強大的雜散電流（如電解車間管道，有時在兩電極上感應的交流電勢峰值Vpp可高達1V），尚需采取另外措施和流量傳感器與管道絕緣等。<br
流體方面：當被測液體中含有均勻分布的微小氣泡通常不影響電磁流量計的正常工作，但隨著氣泡的增大，儀表輸出信號會出現波動，若氣泡大到足以遮蓋整個電極表面時，隨著氣泡流過電極會使電極回路瞬間斷路而使輸出信號出現更大的波動
所謂的運行期故障是指經初期調試并正常運行一段時間后在運行期間出現的故障，如：流量傳感器內壁附著層，遭雷點擊，還有環境條件變化等。
內壁附著層：由于電磁流量計測量含有污臟體或懸浮固體的機會比其他流量計多，導致內壁附著層產生故障的概率也就更高。若是絕緣性附著層，電極表面被絕緣而斷開測量電路；若是高電導率附著層，電極間的電動勢被短路，這兩種情況均會使儀表無法工作。還有若是附著層電導率與液體電導率相近，儀表仍能正常工作，只是改變流通的面積，造成測量誤差的隱性故障。
遭雷電擊 ：在線路中感應瞬時浪涌電流和高電壓時遭遇雷電擊，信號進入儀表就會損壞儀表。雷電擊損儀表有三條引入途徑：激磁線，電源線和傳感器與轉換器間流量信號，但是從雷電故障損壞零件的角度分析，引起故障的感應高電壓和浪涌電流大部分是從控制室電源接線路引入的，而另外兩條是較少的。
環境條件變化：主要的原因同調試期故障環境方面，只是干擾源不在調試期出現而在運行期間再介入。如一些接地保護并不理想的電磁流量計，調試期因為沒有干擾源，儀表卻仍能正常工作，但是在出現新干擾源，儀表的輸出信號就會大幅度波動，不能正常工作！
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