柴油滋生細菌已成為近年來許多船主關心的問題。 細菌、藻類和霉菌的混合物污染儲存油艙然后繁殖 – 進而在燃油系統內產生粘滑，膜狀的表層。
油艙中進水是柴油滋生細菌的常見的溫床；細菌以燃油為食，但需要水才能生存和成長。而從細菌中滋生的排泄物可阻塞過濾器（導致供油不足）更糟的是，磨損噴油器和導致發動機故障。
生物柴油燃料和水分離
隨著生物柴油燃料越來越多地在海運工業中作為標準燃油使用，柴油滋生細菌的情況正變得越來越普遍。在英國，最常用的燃油是“B7”（即意味著柴油中含有7％的生物柴油）。生物柴油含量的比例越高，傳統過濾系統將水從燃油中分離就越困難 - 并且燃油中的水越多，柴油滋生細菌的可能性就越大。
這就是燃油清潔系統，如Racor的燃油清潔模塊為船主提供的優勢所在。通過定期清潔燃油并保持油艙內干燥，使得柴油滋生細菌的機會大大減少。而且，即使在油艙中產生了細菌，安裝一個清潔模塊就可以濾除那些有害的污染物。
使用燃油清潔系統，解決柴油滋生細菌問題
燃油清潔系統的工作原理就像透析機一樣。燃油油道通過主過濾器進入發動機；但你也可以將一個獨立的循環回路，過濾器和泵安裝到供油系統中。
當船只停泊且發動機處于停機狀態時，燃油清潔系統會將燃油從油艙中吸出，通過過濾器，然后重新送回油艙。當燃油通過過濾器時，該系統將濾除所有的水分和污染物 - 這通常意味著可實現更少的維護，并有助于使發動機運行更長的時間。
目前市場上可選用的燃油清潔系統的范圍很廣。從僅配有小型輸油泵和過濾器的經濟的系統，到配有濕度傳感器、自動排水裝置和計時器的復雜和昂貴的選擇。但原理都是相同的。 Racor的燃油清潔模塊綜合了燃油過濾和油水分離；可在一個整裝單元中容納低壓燃油泵和組件，該系統提供清潔、干燥的燃油到供油系統。
需要記住的是清潔系統可以用較小的過濾器進行運行。也可以通過一個計時器，隔夜運行或當船主不在船上時運行。這對于那些受細菌影響或可能受其影響的船只，是最能發揮作用的。
另一種選擇是，無論油艙本身是否有一個清潔系統，都將一種添加劑加入油艙。這種做法可殺死細菌并抑制其生長。
抑制柴油滋生細菌問題可成為一項重要的工作，并且可能是非常昂貴的。在某些情況下，船主可能很“幸運”，可雇用專業油艙清潔公司來進行清理；但這通常要花好幾百英鎊。
但是，如果油艙無法清理干凈，可能需要結構性調整以移除或更換油艙 – 這可能要花費數千英鎊。因此，船主采取的預防措施越多，就越能更好地抑制或減少柴油滋生細菌的機會以及降低相關費用。