為提高儀器的使用效率并使儀器操作簡單化，操作者并不在儀器計算機上處理譜圖，而是下載后自行處理。為防止病毒感染儀器計算機使系統遭到破壞并避免過多訪問者拜訪儀器計算機使其工作性能下降，取核磁樣品文件需通過所里的服務器。服務器中的程序每隔半小時從儀器計算機中取核磁文件，文件的前3個字符為組長代碼，程序識別出組后把文件放入服務器相應的組長目錄下。樣品的所有者通過所里局域網下載Fid文件后自己用NUTS軟件進行傅立葉變換、積分、打印譜圖等后期處理。
使用Mifare射頻卡進行上機人員身份驗證為避免未培訓過的人上機對儀器造成損壞和有效的追蹤儀器的使用狀況，我所自行開發了一套開放儀器管理系統。開放儀器用所里考勤卡進行上機資格認證。所里的考勤卡為Mifare卡，是非接觸式射頻卡。整套儀器控制系統通過一臺控制用計算機進行卡號采集，儀器使用控制與數據處理。平時控制計算機通過KVM切換器鎖住儀器計算機的鍵盤和鼠標，需要的話也可控制顯示器。當上機者在Mifare讀卡器上打過卡后，讀頭把卡號傳送到控制計算機，控制計算機把卡號與數據庫中的信息進行對比，如符合上機資格，則為鼠標與鍵盤解鎖，如不符合，則無效。
上機者做完試驗再打一下卡，鼠標與鍵盤重又處于鎖定狀態。控制計算機把開始實驗時間與結束實驗時間記錄于數據庫中，如上機者在做完實驗后忘記打卡，則把下一位上機者打卡上機的時間作為其結束時間，并在數據庫中記錄為其非正常退出。數據庫按月出使用記錄和使用時間的報表，各個課題組可通過網絡對儀器使用狀況進行查詢。由于使用計算機RS232接口與Mifare讀卡器進行通訊讀入卡號，用IO卡對KVM切換器進行控制，故只需加一塊串口擴展卡，就可實現對多臺儀器進行控制。