紫外線消毒器的水力限制基本原理：
基于現有的可以獲得的信息，紫外線照射區內的水流過量的縱向混合導致某些部分照射不充分，類似的，不充分的橫向混合也可能導致同的情況出現。合理的污水紫外線消毒器進口結構和渠道設計可以保證多級反應器的第一個反應器中的流速均勻。同樣，合理的污水紫外線消毒器出口和管道系統設計也能確保出口狀況不會對最后一個反應器的水力狀態產生不利影響。一般都希望有均勻的流速分布，但是這并不能保證紫外線照射區域有良好的水力條件。當進出口條件不一致，例如幾何形狀、擴散器或流體控制器的位置，需要測量流速在污水紫外線消毒器中的分布。
紫外線消毒器的反應器的進出口設計由紫外線設備生產商負責，且用速率圖表示。速度分布的水力學測試必須包括在紫外線消毒系統性能驗證協議內。在驗證后的紫外線設備的實際安裝中必須維持進出口流速分布。如果進出口狀況與驗證后的系統相同，便不再需要速率圖。在任何情況下，多級反應器都必須在與設備嚴整的相同速度范圍內運行。
在飲用水中應用的紫外線消毒器系統，不能因為紫外線消毒器價格因素而允許把小規模設備放大來用。只能使用根據紫外線消毒驗證協議的實際反應器。驗證后反應器模塊排列能在實際應用中使用。