一般情況下，超聲波清洗機使用時其頻率的高低，很多時間決定了超聲波清洗機的清洗效果。超聲空化閥值和超聲波清洗機的頻率有密切關系，頻率越高，空化閥越高。也就是說：頻率低，空化越容易產生，而且在低頻情況下液體受到壓縮和稀疏作用有更長的時間間隔，使氣泡在解體前能生長到較大的尺寸。因此我們可以通過增高空化強度，提高清洗效率。
頻超聲清洗機適用于大部件外表或者污物和清洗件外表結合度高的場所。但易腐蝕清洗件表面，不適宜清洗外表光潔度高的部件，而且空化噪音大。40KHZ左右的頻率，相同聲強下，發生的空化泡數量比頻率為20KHZ時多，穿透力較強，宜清洗外表形狀復雜或有盲孔的工件，空化噪音較小，但空化強度較低，適合清洗污物與被清洗件外表結合力較弱的場所。高頻超聲清洗適用于計算機，微電子元件的精細清洗；兆赫超聲清洗適用于集成電路芯片、硅片及波薄膜的清洗，能去除微米、亞微米級的污物而對清洗件沒有任何損傷。
因此從清洗效果及經濟性考慮，超聲波清洗機在使用時的頻率一般選擇在20-130KHZ范圍。